Embark uitslag van Dali

[mizzsylver]

In een topic laatst over inteelt gemeten op DNA niveau had ik al verteld dat ik van Dali een swab had opgestuurd naar Embark.
Ik heb de ICB Breeder Tool besteld maar het testen gaat via Embark totdat ze zelf de mogelijkheid heeft om te testen. Vandaar dat ik ook eerst de uitslag van Embark heb gekregen.
De raw data files zijn al naar ICB gestuurd en daarvan heb ik nog geen uitslag.

Maar nu eerst de Embark uitslag!
Dali is een 100% Duitse herder, toch leuk om dat bevestigd te zien
Embark test op 160 erfelijke aaandoeningen waarvan 8 relevant voor de Duitse herder, en Dali is van alle helemaal vrij.
Ook op kleur wordt er getest, maar de A locus is niet helemaal duidelijk, ik had gehoopt te kunnen zien of Dali recessief zwart draagt maar dat is niet mogelijk. Er staan 3 mogelijke opties, waarvan er voor Dali 2 mogelijk zijn.
Verder weet ik nu ook dat ze langhaar draagt en dus langharige pups kan krijgen.

Toen kwam het interessante stukje, de inteelt coëfficiënt. Ik was er heel erg benieuwd naar, vooral omdat Dali een pup uit combifok is. De moeder komt uit showlijn Duitse herders en de vader uit werklijn.
In zooeasy over 10 generaties gemeten is haar COI 0,4%. Best netjes vond ik. Over alle generaties zover bekend in zooeasy kwam ze al aan de 2,5%.
Maar de gemeten waarde komt heel erg veel hoger uit dan ik verwachtte, namelijk op 23%

Ik heb het profiel van Dali openbaar gezet voor wie het interessant vind:

Profiel Dali

Nu eens gaan bedenken hoe verder. Ik wacht in elk geval eerst de Breeder Tool uitslag af, bij interesse zal ik hier updaten.

[Lizzy]

In een topic laatst over inteelt gemeten op DNA niveau had ik al verteld dat ik van Dali een swab had opgestuurd naar Embark.
Ik heb de ICB Breeder Tool besteld maar het testen gaat via Embark totdat ze zelf de mogelijkheid heeft om te testen. Vandaar dat ik ook eerst de uitslag van Embark heb gekregen.
De raw data files zijn al naar ICB gestuurd en daarvan heb ik nog geen uitslag.

Maar nu eerst de Embark uitslag!
Dali is een 100% Duitse herder, toch leuk om dat bevestigd te zien
Embark test op 160 erfelijke aaandoeningen waarvan 8 relevant voor de Duitse herder, en Dali is van alle helemaal vrij.

Mag ik vragen welke 8 dat zijn?

Ook op kleur wordt er getest, maar de A locus is niet helemaal duidelijk, ik had gehoopt te kunnen zien of Dali recessief zwart draagt maar dat is niet mogelijk. Er staan 3 mogelijke opties, waarvan er voor Dali 2 mogelijk zijn.
Verder weet ik nu ook dat ze langhaar draagt en dus langharige pups kan krijgen.

Toen kwam het interessante stukje, de inteelt coëfficiënt. Ik was er heel erg benieuwd naar, vooral omdat Dali een pup uit combifok is. De moeder komt uit showlijn Duitse herders en de vader uit werklijn.
In zooeasy over 10 generaties gemeten is haar COI 0,4%. Best netjes vond ik. Over alle generaties zover bekend in zooeasy kwam ze al aan de 2,5%.
Maar de gemeten waarde komt heel erg veel hoger uit dan ik verwachtte, namelijk op 23%

Ik heb het profiel van Dali openbaar gezet voor wie het interessant vind:

Profiel Dali

Nu eens gaan bedenken hoe verder. Ik wacht in elk geval eerst de Breeder Tool uitslag af, bij interesse zal ik hier updaten.

So de knetter, dat is wel heel erg veel hoger dan wat je in Zoo Easy hebt berekend! Hoeveel generaties ga je terug in Zoo Easy?

Nou ja, dit zou dan een strak voorbeeld kunnen zijn van "je gaat met werk/showlijn terug naar de andere lijn en dat is outcross". Ja, mijn neus natuurlijk als je allemaal dezelfde founders hebt voor je show en werklijn.

[mizzsylver]

Je kunt die 8 ook zien in haar profiel als het goed is, maar het zijn deze:
Multidrug Sensitivity (MDR1)
Factor VIII Deficiency, Hemophilia A (F8 Exon 11)
Canine Leucocyte Adhesion Deficiency Type III (FERMT3)
Hyperuricosuria and Hyperuricemia or Urolithiasis (SLC2A9)
X-linked Ectodermal Dysplasia, Anhydrotic Ectoderal Dysplasia (EDA Intron 8)
Renal Cystadenocarcinoma and Nodular Dermatofibrosis (RCND) (FLCN Exon 7)
Mucopolysaccharidosis Type VII, Sly syndrome (GUSB Exon 3)
Degenerative myelopathy (SOD1 Exon 2)

In zooeasy gaan we ongeveer 55-60 generaties terug tot aan de founders maar nog niet haar hele stamboom is verbonden. Het gaat over zoveel honden, en dat allemaal alleen al nakijken is veel werk. Ik ben er bijna elke dag wel mee bezig maar het is nog niet af.

En inderdaad valt het niet onder outcross, maar zo hoog had ik het niet verwacht. Wel hoger dan wat ik had berekend, en ik wil niet weten hoe hoog de werkelijke COI is van bvb haar moeder met een berekende COI van 9% in Zooeasy.
Nou ja ik wil het dus wel weten, nog even sparen want ik vind het wel errug duur

[Lizzy]

Ik was nog niet bij de laatste tab aanbeland bij het bestuderen van het profiel en was toch wel stikbenieuwd omdat ik dit soort testen eerder heb gezien en daar werden honden voor allerlei genetische ziektes getest en vrij bevonden, zelfs voor afwijkingen/ziektes waar helemaal nog geen DNA test voor beschikbaar is

Dat is natuurlijk mooi, dat ze nergens drager van is. Maar een COI van 23% is wel schrikken. Ik denk eerlijk gezegd dat dit voor vrijwel alle rashonden het geval zal zijn hoor. En nog wel hoger ook.

[kira]

Waar is die test te bestellen? Ben nl enorm benieuwd waar onze jongste op uit zou komen en onze oudste. Is het verschil groot of blijkt het dus eigenlijk in beide gevallen een enorm ingeteelde hond te zijn.

Die onderzochte aandoeningen waar vrij op staat komen die veel voor bij de Duitse herder?

[mizzsylver]

Waar is die test te bestellen? Ben nl enorm benieuwd waar onze jongste op uit zou komen en onze oudste. Is het verschil groot of blijkt het dus eigenlijk in beide gevallen een enorm ingeteelde hond te zijn.

Die onderzochte aandoeningen waar vrij op staat komen die veel voor bij de Duitse herder?

Klik hier om de test te bestellen, met code FRIEND30 krijg je ook nog 30 dollar korting maar het blijft een dure test. Je krijg er wel echt wat voor terug, en het is wel degelijk spul. Waar je bij VHL en Laboklin gewoon een swabje opgestuurd krijgt, krijg je bij embark een doosje met duidelijke uitleg, retourenveloppe en een penning met QR code waarbij je als je die scant meteen naar het profiel van je hond gaat.
Ook wordt je van elke stap in het proces op de hoogte gehouden. Best een aanrader dus, maar wel een prijzige.

Van de aandoeningen komt DM wel veel voor, Heamofilie hoor je nog wel eens en RCND in bepaalde lijnen.

Als je de test doet hou je ons op de hoogte? Ben erg benieuwd.